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Omicron 変異体の中和、エフェクター機能、免疫インプリンティング
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Omicron 変異体の中和、エフェクター機能、免疫インプリンティング

Aug 19, 2023

自然 (2023)この記事を引用

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メトリクスの詳細

現在流行している SARS-CoV-2 変異株は、スパイクタンパク質の受容体結合ドメイン 1 (RBD) のホットスポットで収束変異を獲得しています。 これらの変異がウイルスの感染と伝播に及ぼす影響や、ワクチンと治療法の有効性については、まだ十分に理解されていない。 今回我々は、最近出現したBQ.1.1およびXBB.1.5変異体が高い親和性で宿主ACE2に結合し、初期のOmicron変異体よりも効率的に膜融合を促進することを実証する。 S309 抗体 (ソトロビマブの親抗体) およびヒト ACE2 のフラグメント抗原結合領域に結合した BQ.1.1、XBB.1、および BN.1 RBD の構造は、立体構造選択、ACE2 認識の変化による抗体結合の保存を説明しますそして免疫回避。 我々は、ソトロビマブがすべてのOmicron変異体に強く結合し、Fc依存性エフェクター機能を促進し、BQ.1.1で攻撃されたマウスおよびXBB.1.5で攻撃されたハムスターを保護することを示す。 ワクチン誘発ヒト血漿抗体は、中和活性が低下しているにもかかわらず、現行の Omicron 変異体と交差反応し、エフェクター機能を誘発することから、S309 に代表される疾患に対する防御機構が示唆されています。 交差反応性 RBD 指向性ヒト記憶 B 細胞は、Omicron スパイクへの 2 回の曝露後でも優勢なままであり、持続的な免疫インプリンティングの役割を強調しています。

2021 年末の SARS-CoV-2 オミクロン (B.1.1.529) 変異株の出現は、新型コロナウイルス感染症パンデミックの新たな段階を示しました 2。そのスパイク (S) 糖タンパク質に数十のアミノ酸変異を抱えた系統が主要なものとなっています。受容体結合の強化、細胞内部移行経路の変化、中和抗体3、4、5、6 (nAb) からの前例のない回避です。 その結果、連続する系統（BA.1/BA.1.1、BA.2、BA.5など）によって引き起こされる感染の波が繰り返し発生し、これには複数回の新型コロナウイルス感染症ワクチン接種を受けた個人も含まれていました。

RBD 指向性抗体はワクチン適合ウイルスおよび不適合ウイルスに対する中和活性の大部分を占めますが、N 末端ドメインは主に変異体特異的 nAb の標的となります 7、8、9、10。 収斂進化により、現在流通している Omicron 変異系統は、推定される BA.2 および BA.5 祖先と比較して、RBD および N 末端ドメイン (NTD) の主要な抗原部位で同一または類似のアミノ酸変異を独立して獲得しました1。 BA.2.75.2系統は複数の国（インドなど）で頻度が増加しており、BA.2と比較してRBD変異D339H、R346T、G446S、N460K、F486SおよびR493Qを持っています（図1a）。 CH.1.1は2022年11月に出現し、その後ヨーロッパの感染症の約12％を占め、BA.2.75.2と比較してK444TおよびL452R RBD残基変異を保有しています。 BN.1 は BA.2.75 の子孫であり、BA.2 と比較して D339H、R346T、K356T、G446S、N460K、F490S および R493Q RBD 変異を保有しています。 2023年1月に韓国で配列決定されたSARS-CoV-2ゲノムの半分以上を占めたBN.1系統は、K356T変異によりN354位に追加のRBD N結合型グリコシル化セクオンを特徴としている11。 XBB は BJ.1 および BM.1.1.1 (BA.2.75 亜系統) からの組換え体であり、S に G252V 変異を追加すると、D339H、R346T、L368I、V445P、G446S、N460K、F486S、F490S を有する XBB.1 が生成されました。 BA.2と比較したR493Q RBD置換（図1a）。 さらに、486 位にセリンの代わりにプロリンを含む XBB.1.5 系統 (Wuhan-Hu-1 株 (以下、Wu) の F486) は、2023 年 3 月初旬までに世界的に優勢になりました。BQ.1および BQ.1.1 はいくつかの西側諸国で優勢であり、2023 年 1 月に米国で配列決定されたすべての SARS-CoV-2 ゲノムの最大 55% を占めていました。BQ.1.1 には、BA.5 と比較して R346T、K444T、および N460K RBD 変異があります (図1a)。 この記事では、循環している SARS-CoV-2 変異株における S 変異の集合が、ウイルスの機能特性や、ワクチンや治療用抗体を含む利用可能な臨床対策にどのような影響を与えるかを理解することを目指しました。 さらに、免疫インプリンティングを研究し、将来のワクチンの設計と展開を導くために、SARS-CoV-2およびCOVID-19ワクチンへの現実世界の曝露を代表するヒトコホートにおける体液性および記憶免疫応答を調査します。